Từ tháng 8/2015, Ông được bổ nhiệm giữ chức vụ Phó Cục trưởng Cục CNTT - NHNN, quản lý trực tiếp Phòng Quản lý các dự án CNTT và Phòng Quản lý hạ tầng CNTT; từ tháng 6/2017 được giao quản lý trực tiếp Phòng an ninh thông tin và chứng thực chữ ký điện tử, phụ trách mảng An ninh mạng.

Tháng 1/2019, Ông được giới thiệu và bổ nhiệm vị trí Tổng Giám đốc, thành viên HĐQT Công ty Cổ phần Thanh toán Quốc gia Việt Nam (NAPAS).

Trong thời gian công tác tại NHNN, Ông đã trực tiếp tham gia và chỉ đạo triển khai và tổ chức vận hành các hệ thống CNTT quan trọng của NHNN như: Hệ thống Thanh toán điện tử liên ngân hàng (IBPS), Hệ thống Ngân hàng lõi (Corebanking), Hệ thống Kế toán, lập ngân sách (ERP), Hệ thống quản lý đấu thầu và nghiệp vụ thị trường mở (AOM), Trục tích hợp dữ liệu (ESB), Hệ thống quản lý và cấp chứng thư số (CA), Hệ thống kho dữ liệu tập trung (DW); Tham gia, chỉ đạo nghiên cứu và đề xuất Thống đốc NHNN ban hành một số Thông tư trong lĩnh vực CNTT và An ninh bảo mật áp dụng trong nội bộ NHNN và ngành Ngân hàng. 

Quá trình công tác tại NHNN, Ông tham gia triển khai một số dự án CNTT lớn như:

- Dự án Chuyển tiền tiện tử NHNN (giai đoạn 1 và giai đoạn 2);

- Dự án Bù trừ điện tử NHNN;

- Dự án Xây dựng hệ thống báo cáo thống kê điện tử NHNN;

- Dự án FSMIMS:

+ Dự án “Ngân hàng lõi, kế toán, lập ngân sách và tích hợp hệ thống cho NHNN”;

+ Dự án “Quản trị cơ sở dữ liệu, kho dữ liệu và các ứng dụng liên quan cho NHNN”; 

- Dự án “Nâng cấp hệ thống CA cho NHNN”.

​

​ ​Vào tháng 12/2011, Ông được bổ nhiệm vào vị trí Phó Tổng Giám đốc của Công ty Cổ phần Chuyển mạch tài chính Quốc gia Việt Nam (Banknetvn) và trở thành Giám đốc Điều hành của Banknetvn vào tháng 09/2013.

Từ tháng 04/2015, Ông được bổ nhiệm vào vị trí Phó Tổng Giám đốc của Banknetvn sau thương vụ sáp nhập giữa Banknetvn và Smartlink, chịu trách nhiệm cho mảng Nghiên cứu Phát triển. Banknetvn là tổ chức được cấp giấy phép cho dịch vụ chuyển mạch và bù trừ điện tử tại Việt Nam. Từ tháng 02/2016, Banknetvn đã đổi tên thành Công ty cổ phần Thanh toán Quốc gia Việt Nam (NAPAS).

Đảm nhiêm chức vụ Phó Tổng Giám đốc của NAPAS, Ông đã chỉ đạo triển khai thành công các dự án kết nối liên thông hệ thống thanh toán thẻ của các ngân hàng thành một mạng thanh toán thống nhất trên toàn quốc, cung cấp các sản phẩm dịch vụ thanh toán điện tử đem lại nhiều tiện ích cho các khách hàng sử dụng thẻ, hỗ trợ tích cực cho sự phát triển thị trường thanh toán không dùng tiền mặt tại Việt Nam theo sự chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ và Ngân hàng Nhà nước Việt Nam.

Các dự án tiêu biểu bao gồm: ​

​​​Các dự án nói trên góp phần rất quan trọng trong việc phát triển hạ tầng ổn định cho thanh toán không dùng tiền mặt tại Việt Nam​.​ 

​ ​Từ năm 2009 tới tháng 3/2015, trong vai trò là Phó Tổng Giám đốc phụ trách Kinh doanh và Công nghệ của Công ty cổ phần Dịch vụ Thẻ Smartlink, một trong 2 liên minh Thẻ lớn nhất Việt nam. Ông đã tổ chức ứng dụng các giải pháp kỹ thuật vào thực tế thị trường để đưa ra các dịch vụ giá trị gia tăng như tiện ích thanh toán hoá đơn, nạp tiền trên các kênh điện tử ngân hàng cũng như triển khai thành công dịch vụ cổng thanh toán điện tử cho các doanh nghiệp lớn hoạt động tại Viêt nam trong lĩnh vực hàng không như Vietnam Airlines, VietjetAir, AirAisa v.v... hay lĩnh vực viễn thông như Mobifone, Vinaphone, Viettel v.v..

Tham gia làm việc từ những ngày đầu tiên của Công ty Smarltink, Ông đã cùng đối tác để tiến hành kết nối 03 liên minh thẻ Việt nam là Smartlink, Banknetvn và V.N.B.C tiến tới hợp nhất mạng lưới ATM/POS bước đầu kiến tạo hạ tầng thanh toán quốc gia thống nhất qua đó thúc đẩy thanh toán không dùng tiền mặt tại Việt nam.

Trước Smartlink, từ năm 2000 tới 2007, Ông Nguyễn Đăng Hùng giữ vị trí Phó Phòng Tích hợp và Phát triển hệ thống của Công ty VDC/VNPT. Ở vị trí này, Ông cùng các đồng sự của mình tham gia công tác tư vấn, thiết kế, triển khai và quản lý nhiều dự án công nghệ thông tin và viễn thông có hàm lượng tích hợp hệ thống cao cho các Tổng công ty lớn của Nhà nước cũng như các cơ quan cấp Bộ, Chính phủ và cấp tỉnh trên toàn quốc. Trong những năm 1997-2002, Ông Nguyễn Đăng Hùng cũng trực tiếp tham gia vào nhóm kỹ thuật kết nối Internet đầu tiên của Viêt nam tại công ty VDC/VNPT có nhiệm vụ thiết kế, quản trị và vận hành mạng Internet của công ty VDC/VNPT đồng thời hỗ trợ tích cực cho các nhà cung cấp dịch vụ Internet khác thời kỳ đó ở Việt nam như FPT, Viettel, Netnam v.v.. ​

​ Từ tháng 1/2016, Ông được bổ nhiệm vào vị trí Phó Tổng Giám đốc – Phụ trách Kỹ thuật của Công ty Cổ phần Thanh toán Quốc gia Việt Nam (NAPAS).

Là chuyên gia hàng đầu trong lĩnh vực Thanh toán Thẻ với hơn 10 năm kinh nghiệm ở các mảng Tư vấn và Giải pháp Thanh toán, hiện với vai trò là Phó Tổng Giám đốc – Phụ trách Kỹ thuật của NAPAS, Ông chịu trách nhiệm chung về công tác vận hành hạ tầng Công nghệ Thông tin, cũng như chỉ đạo phát triển nền tảng số hoá của Công ty, hướng đến mục tiêu giúp cho hệ thống thanh toán điện tử tại Việt Nam nhanh hơn, an toàn hơn và có nhiều tiện ích hơn cho khách hàng.

Các dự​ án tiêu biểu bao gồm: ​

​- Triển khai kết nối liên thông hệ thống chuyển mạch ATM/POS​ ​

​ Vào tháng 8/2007, Ông được bổ nhiệm vị trí Phó Tổng Giám đốc của Công ty cổ phần Dịch vụ thẻ Smartlink, phụ trách mảng Nghiên cứu Phát triển sản phẩm và Triển khai Giám sát dịch vụ.

Từ tháng 4/2015, Ông được bổ nhiệm vào vị trí Phó Tổng Giám đốc của Công ty cổ phần Chuyển mạch tài chính Quốc gia Việt Nam (Banknetvn) sau thương vụ sáp nhập giữa Banknetvn và Smartlink, chịu trách nhiệm cho mảng Nghiệp vụ. Banknetvn là tổ chức được cấp giấy phép cho dịch vụ chuyển mạch và bù trừ điện tử tại Việt Nam. Từ tháng 2/2016, Banknetvn đã đổi tên thành Công ty cổ phần Thanh toán Quốc gia Việt Nam (NAPAS).

Đảm nhiêm chức vụ Phó Tổng Giám đốc của Smartlink và Banknetvn (hiện tại là NAPAS), Ông đã chỉ đạo triển khai thành công các dự án kết nối liên thông hệ thống thanh toán thẻ của các ngân hàng thành một mạng thanh toán thống nhất trên toàn quốc, cung cấp các sản phẩm dịch vụ thanh toán điện tử đem lại nhiều tiện ích cho các khách hàng sử dụng thẻ, hỗ trợ tích cực cho sự phát triển thị trường thanh toán không dùng tiền mặt tại Việt Nam theo sự chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ và Ngân hàng Nhà nước Việt Nam.

Các dự án tiêu biểu bao gồm: ​

​​​Các dự án nói trên đã được triển khai thành công và góp phần quan trọng trong việc phát triển hạ tầng ổn định cho thanh toán không dùng tiền mặt tại Việt Nam.​​